本科阶段：本科阶段学制4年，无法在规定年限内完成本科修业计划则分流至普通班。学生实行个性化培养方案，，修完培养计划规定的课程及教学实践环节，取得规定的学分，完成毕业设计（论文）且通过答辩，完成学校规定的其它毕业要求，准予毕业。同时，按照《上海交通大学关于授予本科学士学位的规定》，符合授予条件的学生，可授予理学学士学位。
博士阶段：在规定的学习年限内完成培养计划，课程成绩合格并达到规定的总学分和积点，通过学位论文评审及答辩、且符合学校和学院规定的学术论文发表要求，无学术诚信问题者，按照《上海交通大学关于申请授予博士学位的规定》，可申请授予博士学位。
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